胜利捷报使到长安，李世民想把高昌国纳入唐朝版图，设置州县。

魏征进谏：

“陛下即位不久，麹文泰就入朝拜见，还算恭顺。

近来骄横叛逆，阻挡西域各国进贡道路，还截留各国送唐贡品，我国才兴兵前往征讨。

如今麹文泰已经病亡，上已惩罚了他。

如今为陛下着想，应该安抚他们的百姓，继续存留他们的国家。

册立他的后代为新国君，恩威并施，才能长远下去。

如果把高昌国土地，当作战利品，改设唐朝州县，此后至少得安排两千人军队镇守。

每年得有几千人翻越沙漠，往来两地。

朝廷还得为驻守军队提供军饷、夏季冬季衣服、吃住费用。

驻守兵士远离亲人几千里，必定苦苦思念家乡。

同时，陛下从高昌那边得不到一把米、一尺绢帛，用来补充朝廷开支。

收归过来有害无益，我认为陛下不如不要高昌国这片土地！”

李世民：

“高昌旧地，是西域各国和华夏通商必经之路，这条路如果一直在别国手上，能确保畅通么？

只算眼下得失，势必满足于国寡民，账可不是这样算。

国力强大，四夷威服，让外国敬重我国，首先得疆域辽阔。

为华夏千秋万代计，即使沙漠戈壁，千里不毛之地，也是我国财富，不可轻易丢弃，任他人占去。

何况高昌不是沙漠戈壁，多有雪山融水成河，灌溉农庄田园。”

李世民没有听从魏征建议，下诏改高昌为西州，州府设在交河城。

随后设置安西都护府，派军队驻扎守卫。

并诏令侯君集率大军还朝。

侯君集率领军队押着高昌国王麹智盛，还有麹智盛的弟弟麹智湛，一路高奏凯歌还朝。